Investigadores del Hospital Clínico San Cecilio participarán en la secuenciación del genoma del coronavirus para conocer el pronóstico de la Covid-19

Escrito por FRANCISCO ASIS HERRERA el 11 jun. 2020
El responsable del Laboratorio de Microbiología, Federico Garcia, forma parte del equipo de investigadores principales conformado por la Consejería de Salud y Familias
Investigadores del Hospital Clínico San Cecilio participarán en la secuenciación del genoma del coronavirus para conocer el pronóstico de la Covid-19

Investigadores del Hospital Universitario Clínico San Cecilio participarán en el estudio de investigación que secuenciará más de 1.000 muestras del virus SARS-CoV-2 procedentes de 15 hospitales de Andalucía para conocer el comportamiento de la Covid-19 y poder tomar decisiones clínicas en base a ello. El responsable del Laboratorio de Microbiología del hospital forma parte del equipo de investigadores principales conformado por la Consejería de Salud y Familias.

Este proyecto permitirá demostrar la utilidad de la secuencia genómica del virus como herramienta para su posterior aplicación en la práctica diaria de atención a a esta epidemia, pero también para prevenirun posible nuevo brote u otras epidemias venideras. Para ello, desde el Área de Bioinformática de la Fundación Progreso y Salud y desde la Dirección General de Salud Pública (Servicio de Vigilancia Epidemiológica y Salud Laboral) de la Consejería de Salud y Familias, se ha impulsado este estudio, que cuenta con el apoyo de 15 hospitales que cubren todas las provincias de Andalucía, los 5 institutos de investigación sanitaria de la comunidad autónoma y la Subdirección Técnica de Gestión de la Información de la Consejería de Salud y Familias.

El estudio usará la red de centros de diagnóstico de la comunidad andaluza y los secuenciadores de los institutos de investigación sanitaria y centros asociados para secuenciar unas 1.000 muestras del virus SARS-CoV-2, cubriendo toda Andalucía y representando una muestra lo más equilibrada posible de las distintas tipologías de pacientes (edad, sexo, complicaciones previas, tratamientos previos), así como los distintos cuadros clínicos observados y las respuestas a los tratamientos.

Los datos genómicos asociados a estos datos clínicos, que pueden ser enriquecidos con información de la Base Poblacional de Salud, serán utilizados para obtener biomarcadores diagnósticos y pronósticos de forma rápida. Además, serán utilizados para hacer un seguimiento epidemiológico de la enfermedad en tiempo real y permitirán el desarrollo de un recurso informático de Big Data genómico y clínico para la realización de futuros proyectos de investigación.

La secuenciación es fundamental para conocer mejor el virus y definir sus características y comportamiento. Con esta tecnología se puede conocer y descifrar el código genético del nuevo coronavirus para poder combatirlo.

En este estudio participan como investigadores principales además de Federico García, Joaquín Dopazo (Fundación Progreso y Salud), Nicola Lorusso y Francisco J. García León (Dirección General de Salud Pública), y José María Navarro (Hospital Virgen de las Nieves).

Programa de Investigación Clínica

Este estudio se une a otros proyectos de investigación y ensayos clínicos en Andalucía en el marco del Programa de Investigación Clínica en COVID-19, puesto en marcha por la Consejería de Salud y Familias hace dos meses con el fin de conocer mejor la enfermedad y con ello mejorar el pronóstico y tratamiento de los pacientes afectados.